Los siguientes procedimientos escritos se clasifican en procedimientos generales y específicos por sector de actividad o por el alcance del control:

PROTOCOLO 4 - ESTABLECIMIENTOS DE ELABORACIÓN Y SERVICIOS DE COMIDAS

PROTOCOLO 5 - INSPECCIÓN DE ESTABLECIMIENTOS DE VENTA DIRECTA AL CONSUMIDOR FINAL

PROTOCOLO 9 - CONTROL OFICIAL DE ESTABLECIMIENTOS ELABORADORES DE MATERIALES EN CONTACTO CON ALIMENTOS

PROTOCOLO 10 - CONTROL GENERAL DE ESTABLECIMIENTOS ALIMENTARIOS

PROTOCOLO 13 - INSPECCIÓN DE ESTABLECIMIENTOS LÁCTEOS

PROTOCOLO 24 - INSPECCIÓN DE ESTABLECIMIENTOS DE VENTA AMBULANTE

PROTOCOLO 38 - INSTALACIONES 

PROTOCOLO 56 – AUDITORÍAS EN EMPRESAS ALIMENTARIAS

PROTOCOLO 57 - AUDITORÍAS EN ALMACENES Y DISTRIBUIDORES

PROTOCOLO 97 - HUEVOS Y OVOPRODUCTOS

PROTOCOLO 60 - BIENESTAR ANIMAL: UNGULADOS

PROTOCOLO 61 - BIENESTAR ANIMAL: AVES

PROTOCOLO 62 - BIENESTAR ANIMAL: CONEJOS

PROTOCOLO 67 - CONTROL GENERAL DE MATADERO DE UNGULADOS

PROTOCOLO 68 - CONTROL GENERAL DE MATADERO DE AVES

PROTOCOLO 69 - CONTROL GENERAL DE MATADERO DE CONEJOS

PROTOCOLO 70 - CONTRO DIARIO DE MATADERO DE UNGULADOS

PROTOCOLO 71 - CONTROL DIARIO DE MATADERO DE AVES

PROTOCOLO 72 - CONTROL DIARIO DE MATADERO DE CONEJOS